怀孕初期晚上睡觉小腹隐隐作痛，可能是生理性原因，也可能是先兆流产、宫外孕、尿路感染等原因。治疗方法包括保胎、手术治疗及抗生素治疗。

1. 生理性原因：孕囊着床过程中，小腹胀痛不适属于正常情况，无需治疗。

2. 先兆流产：孕前三个月，胚胎着床不稳，可能导致流产。若孕妇晚上睡觉有小腹痛，需排除流产迹象。医生指导下可采取保胎治疗。

3. 宫外孕：胚胎着床在子宫腔外，可能引起小腹胀痛。如腹腔内出血，疼痛加剧。尽早就医，医生指导下采取相应保守治疗或手术治疗。

4. 尿路感染：表现为尿频、尿急、尿痛等症状，可能伴小腹隐隐作痛。医生指导下使用抗生素治疗，如阿莫西林、头孢曲松等。

若孕初期晚上睡觉小腹隐隐作痛与其他疾病有关，务必尽早就医，查明原因并及早治疗。